增值税专用发票网上认证系统是指由企业自行扫描识别或手工录入抵扣联票面信息，生成电子数据，通过互联网方式报送国税机关，由国税机关完成认证比对，并将认证结果信息返回企业的方式。

　　这个系统采用先进的互联网远程比对模式，企业可以足不出户随时认证抵扣联，大大简化了现行抵扣联认证的繁琐程序，降低税务机关的征税成本和企业的纳税成本。同时，企业可以实时验证抵扣联发票的真实性。

　　江西省国税局要求，在推行网上认证系统过程中必须坚持两条原则：一是纳税人是使用网上认证系统，还是仍按现行方式直接报送纸质抵扣联到国税机关扫描认证，由纳税人自愿选择；二是使用网上认证系统的纳税人可自愿选择是采取手工录入还是扫描录入，采取手工录入的纳税人可以不购置扫描仪，税务机关和技术服务单位均不得强制纳税人购置。

　　从2007年9月份起，网上认证系统在鹰潭市部分企业进行了试点。截至2007年年底，鹰潭全市纳入防伪税控系统的570户增值税一般纳税人企业全部推行了网上认证系统，通过网上认证系统认证的增值税专用发票占全市认证增值税专用发票总份数的50％。